Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnot8Q9D8X5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnot8Q9D8X5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms