Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Alg13Q9D8C3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms