Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Sdr42e1Q9D665 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sdr42e1Q9D665 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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