Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Krt20Q9D312 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Krt20Q9D312 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Krt20Q9D312 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Krt20Q9D312 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms