Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pramef12Q9D2F1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pramef12Q9D2F1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms