Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Trappc6bQ9D289 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trappc6bQ9D289 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Trappc6bQ9D289 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc6bQ9D289 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc6bQ9D289 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Trappc6bQ9D289 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Trappc6bQ9D289 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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