Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc167Q9D162 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms