Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Exosc7Q9D0M0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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