Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ccdc47Q9D024 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc47Q9D024 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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