Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Tmem39aQ9CYC3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmem39aQ9CYC3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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