Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ykt6Q9CQW1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms