Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccer1Q9CQL2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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