Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rdm1Q9CQK3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rdm1Q9CQK3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms