Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Nipsnap3bQ9CQE1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms