Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Sar1bQ9CQC9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sar1bQ9CQC9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms