Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9CQC3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms