Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Trappc5Q9CQA1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms