Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
1700029P11RikQ9CQ68 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms