Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg3Q9CPX6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms