Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ1

Cox6c, Cytochrome c oxidase subunit 6C, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6cQ9CPQ1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cox6cQ9CPQ1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cox6cQ9CPQ1 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms