Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3b1Q99NB9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3b1Q99NB9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms