Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tdrd1Q99MV1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms