Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn2aQ99KJ0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ubxn2aQ99KJ0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms