Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp11Q99K46 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp11Q99K46 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms