Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psmd6Q99JI4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psmd6Q99JI4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms