Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Klc3Q91W40 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms