Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Krt79Q8VED5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt79Q8VED5 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms