Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnajc28Q8VCE1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms