Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms