Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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Ssh3Q8K330 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Ssh3Q8K330 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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