Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Prpf39Q8K2Z2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms