Protein–RNA interactions for Protein: Q8C156

Ncaph, Condensin complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcaphQ8C156 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NcaphQ8C156 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NcaphQ8C156 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NcaphQ8C156 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NcaphQ8C156 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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NcaphQ8C156 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NcaphQ8C156 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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