Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0D0

Trub1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub1Q8C0D0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trub1Q8C0D0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trub1Q8C0D0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trub1Q8C0D0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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