Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdcl3Q8BVF2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdcl3Q8BVF2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms