Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gtf3c4Q8BMQ2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms