Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms