Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Atg2bQ80XK6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atg2bQ80XK6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms