Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdp1Q7TSG2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms