Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfsf18Q7TS55 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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