Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Usp49Q6P9L4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp49Q6P9L4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms