Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms