Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rcbtb1Q6NXM2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rcbtb1Q6NXM2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms