Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NipblQ6KCD5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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