Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrrcc1Q69ZB0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrrcc1Q69ZB0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms