Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Tfe3Q64092 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tfe3Q64092 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms