Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Slc6a4Q60857 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc6a4Q60857 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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