Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme4Q5SSW2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms