Protein–RNA interactions for Protein: Q5RIS0

Gm11487, Novel protein, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11487Q5RIS0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm11487Q5RIS0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm11487Q5RIS0 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms