Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim41Q5NCC3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim41Q5NCC3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms