Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ndufaf2Q59J78 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ndufaf2Q59J78 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms